Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATP6V1E2Q96A05 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATP6V1E2Q96A05 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP6V1E2Q96A05 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1E2Q96A05 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms