Protein–RNA interactions for Protein: Q95460

MR1, Major histocompatibility complex class I-related gene protein, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MR1Q95460 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MR1Q95460 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MR1Q95460 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MR1Q95460 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MR1Q95460 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MR1Q95460 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MR1Q95460 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MR1Q95460 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MR1Q95460 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MR1Q95460 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MR1Q95460 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MR1Q95460 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MR1Q95460 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MR1Q95460 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MR1Q95460 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MR1Q95460 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MR1Q95460 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MR1Q95460 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MR1Q95460 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MR1Q95460 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MR1Q95460 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MR1Q95460 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MR1Q95460 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MR1Q95460 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MR1Q95460 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MR1Q95460 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MR1Q95460 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MR1Q95460 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MR1Q95460 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MR1Q95460 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MR1Q95460 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MR1Q95460 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MR1Q95460 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MR1Q95460 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MR1Q95460 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MR1Q95460 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MR1Q95460 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MR1Q95460 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MR1Q95460 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MR1Q95460 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MR1Q95460 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MR1Q95460 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MR1Q95460 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MR1Q95460 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MR1Q95460 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MR1Q95460 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MR1Q95460 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MR1Q95460 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MR1Q95460 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MR1Q95460 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MR1Q95460 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MR1Q95460 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MR1Q95460 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MR1Q95460 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MR1Q95460 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MR1Q95460 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MR1Q95460 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MR1Q95460 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MR1Q95460 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MR1Q95460 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
MR1Q95460 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MR1Q95460 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MR1Q95460 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MR1Q95460 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MR1Q95460 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MR1Q95460 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MR1Q95460 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MR1Q95460 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MR1Q95460 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MR1Q95460 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MR1Q95460 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MR1Q95460 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MR1Q95460 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MR1Q95460 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MR1Q95460 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MR1Q95460 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MR1Q95460 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MR1Q95460 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MR1Q95460 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MR1Q95460 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MR1Q95460 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MR1Q95460 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MR1Q95460 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MR1Q95460 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MR1Q95460 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MR1Q95460 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MR1Q95460 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MR1Q95460 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MR1Q95460 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MR1Q95460 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MR1Q95460 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MR1Q95460 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MR1Q95460 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MR1Q95460 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MR1Q95460 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MR1Q95460 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MR1Q95460 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MR1Q95460 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MR1Q95460 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MR1Q95460 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms