Protein–RNA interactions for Protein: Q93052

LPP, Lipoma-preferred partner, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPPQ93052 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LPPQ93052 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LPPQ93052 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LPPQ93052 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LPPQ93052 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LPPQ93052 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LPPQ93052 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LPPQ93052 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LPPQ93052 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LPPQ93052 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LPPQ93052 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LPPQ93052 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LPPQ93052 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LPPQ93052 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LPPQ93052 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LPPQ93052 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LPPQ93052 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LPPQ93052 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LPPQ93052 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LPPQ93052 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
LPPQ93052 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LPPQ93052 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LPPQ93052 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LPPQ93052 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LPPQ93052 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LPPQ93052 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LPPQ93052 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LPPQ93052 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LPPQ93052 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LPPQ93052 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LPPQ93052 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LPPQ93052 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LPPQ93052 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LPPQ93052 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LPPQ93052 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LPPQ93052 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LPPQ93052 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LPPQ93052 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LPPQ93052 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
LPPQ93052 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LPPQ93052 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LPPQ93052 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPPQ93052 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPPQ93052 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPPQ93052 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPPQ93052 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPPQ93052 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPPQ93052 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LPPQ93052 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LPPQ93052 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LPPQ93052 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LPPQ93052 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LPPQ93052 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LPPQ93052 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LPPQ93052 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LPPQ93052 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LPPQ93052 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LPPQ93052 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LPPQ93052 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LPPQ93052 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LPPQ93052 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LPPQ93052 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LPPQ93052 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LPPQ93052 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LPPQ93052 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LPPQ93052 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LPPQ93052 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LPPQ93052 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LPPQ93052 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LPPQ93052 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LPPQ93052 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LPPQ93052 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LPPQ93052 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LPPQ93052 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LPPQ93052 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LPPQ93052 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LPPQ93052 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LPPQ93052 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LPPQ93052 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPPQ93052 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPPQ93052 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPPQ93052 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPPQ93052 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPPQ93052 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPPQ93052 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPPQ93052 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LPPQ93052 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LPPQ93052 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LPPQ93052 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LPPQ93052 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LPPQ93052 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LPPQ93052 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LPPQ93052 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LPPQ93052 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LPPQ93052 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LPPQ93052 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LPPQ93052 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LPPQ93052 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LPPQ93052 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LPPQ93052 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms