Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLP1Q92989 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLP1Q92989 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CLP1Q92989 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CLP1Q92989 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms