Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GATA6Q92908 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATA6Q92908 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATA6Q92908 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms