Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP6NLQ92738 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP6NLQ92738 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP6NLQ92738 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms