Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI5

SLC44A1, Choline transporter-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A1Q8WWI5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC44A1Q8WWI5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC44A1Q8WWI5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC44A1Q8WWI5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms