Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
LMO7Q8WWI1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LMO7Q8WWI1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
LMO7Q8WWI1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
LMO7Q8WWI1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms