Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CHTF18Q8WVB6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CHTF18Q8WVB6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHTF18Q8WVB6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHTF18Q8WVB6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHTF18Q8WVB6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHTF18Q8WVB6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHTF18Q8WVB6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHTF18Q8WVB6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHTF18Q8WVB6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHTF18Q8WVB6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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