Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC12Q8WUD4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC12Q8WUD4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC12Q8WUD4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms