Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSC4DQ8WTU2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SSC4DQ8WTU2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSC4DQ8WTU2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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