Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF398Q8TD17 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF398Q8TD17 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF398Q8TD17 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF398Q8TD17 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF398Q8TD17 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF398Q8TD17 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF398Q8TD17 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF398Q8TD17 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF398Q8TD17 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF398Q8TD17 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF398Q8TD17 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms