Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB22

SPATA20, Spermatogenesis-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA20Q8TB22 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPATA20Q8TB22 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPATA20Q8TB22 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPATA20Q8TB22 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPATA20Q8TB22 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPATA20Q8TB22 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPATA20Q8TB22 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPATA20Q8TB22 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPATA20Q8TB22 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPATA20Q8TB22 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SPATA20Q8TB22 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPATA20Q8TB22 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPATA20Q8TB22 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms