Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SPTSSBQ8NFR3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SPTSSBQ8NFR3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSBQ8NFR3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSBQ8NFR3 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSBQ8NFR3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSBQ8NFR3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSBQ8NFR3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSBQ8NFR3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSBQ8NFR3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSBQ8NFR3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SPTSSBQ8NFR3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSBQ8NFR3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SPTSSBQ8NFR3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms