Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MCPH1Q8NEM0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MCPH1Q8NEM0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MCPH1Q8NEM0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MCPH1Q8NEM0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms