Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE22

SETD9, SET domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9Q8NE22 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SETD9Q8NE22 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SETD9Q8NE22 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SETD9Q8NE22 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms