Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF248Q8NDW4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF248Q8NDW4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF248Q8NDW4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms