Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND25

ZNRF1, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF1Q8ND25 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZNRF1Q8ND25 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNRF1Q8ND25 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNRF1Q8ND25 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms