Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMNTD1Q8N9Z9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LMNTD1Q8N9Z9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMNTD1Q8N9Z9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNTD1Q8N9Z9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNTD1Q8N9Z9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNTD1Q8N9Z9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMNTD1Q8N9Z9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNTD1Q8N9Z9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNTD1Q8N9Z9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNTD1Q8N9Z9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMNTD1Q8N9Z9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms