Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9R8

SCAI, Protein SCAI, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAIQ8N9R8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAIQ8N9R8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAIQ8N9R8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAIQ8N9R8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAIQ8N9R8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCAIQ8N9R8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAIQ8N9R8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCAIQ8N9R8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms