Protein–RNA interactions for Protein: Q8N999

C12orf29, Uncharacterized protein C12orf29, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf29Q8N999 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C12orf29Q8N999 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C12orf29Q8N999 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
C12orf29Q8N999 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
C12orf29Q8N999 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C12orf29Q8N999 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
C12orf29Q8N999 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms