Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6V4

C10orf53, UPF0728 protein C10orf53, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf53Q8N6V4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C10orf53Q8N6V4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C10orf53Q8N6V4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C10orf53Q8N6V4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms