Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC155Q8N6L0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC155Q8N6L0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC155Q8N6L0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC155Q8N6L0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263.3 ms