Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMIM20Q8N5G0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM20Q8N5G0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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