Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO39Q8N4B4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXO39Q8N4B4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO39Q8N4B4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO39Q8N4B4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO39Q8N4B4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO39Q8N4B4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO39Q8N4B4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO39Q8N4B4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO39Q8N4B4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO39Q8N4B4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO39Q8N4B4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO39Q8N4B4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO39Q8N4B4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms