Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NME8Q8N427 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NME8Q8N427 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NME8Q8N427 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NME8Q8N427 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms