Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA5B2Q8N398 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
VWA5B2Q8N398 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VWA5B2Q8N398 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VWA5B2Q8N398 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms