Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCML4Q8N228 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCML4Q8N228 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCML4Q8N228 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCML4Q8N228 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms