Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ52

CHPF, Chondroitin sulfate synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPFQ8IZ52 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHPFQ8IZ52 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHPFQ8IZ52 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHPFQ8IZ52 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHPFQ8IZ52 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHPFQ8IZ52 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms