Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC170Q8IYT3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC170Q8IYT3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC170Q8IYT3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms