Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL2

SFTPA1, Pulmonary surfactant-associated protein A1, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA1Q8IWL2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFTPA1Q8IWL2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFTPA1Q8IWL2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SFTPA1Q8IWL2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms