Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC71Q8IV32 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC71Q8IV32 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC71Q8IV32 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC71Q8IV32 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2988.8 ms