Protein–RNA interactions for Protein: Q86XK3

SFR1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFR1Q86XK3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SFR1Q86XK3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SFR1Q86XK3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SFR1Q86XK3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SFR1Q86XK3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SFR1Q86XK3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.8 ms