Protein–RNA interactions for Protein: Q86VU5

COMTD1, Catechol O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMTD1Q86VU5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COMTD1Q86VU5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COMTD1Q86VU5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COMTD1Q86VU5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMTD1Q86VU5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms