Protein–RNA interactions for Protein: Q86VH5

LRRTM3, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3Q86VH5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRRTM3Q86VH5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRTM3Q86VH5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRTM3Q86VH5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRRTM3Q86VH5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms