Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATG4DQ86TL0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4DQ86TL0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATG4DQ86TL0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATG4DQ86TL0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms