Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5N4

SDK1, Protein sidekick-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK1Q7Z5N4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SDK1Q7Z5N4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SDK1Q7Z5N4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDK1Q7Z5N4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms