Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM46Q7Z4K8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM46Q7Z4K8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM46Q7Z4K8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms