Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS6

OTOP2, Otopetrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP2Q7RTS6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OTOP2Q7RTS6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OTOP2Q7RTS6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
OTOP2Q7RTS6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
OTOP2Q7RTS6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms