Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SV2AQ7L0J3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SV2AQ7L0J3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SV2AQ7L0J3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SV2AQ7L0J3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms