Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC80Q76M96 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC80Q76M96 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC80Q76M96 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms