Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4W1

NSMF, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMFQ6X4W1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NSMFQ6X4W1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NSMFQ6X4W1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
NSMFQ6X4W1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSMFQ6X4W1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms