Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00575Q6W349 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00575Q6W349 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00575Q6W349 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms