Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUC0

TFAP2E, Transcription factor AP-2-epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAP2EQ6VUC0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TFAP2EQ6VUC0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TFAP2EQ6VUC0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TFAP2EQ6VUC0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms