Protein–RNA interactions for Protein: Q6R6M4

USP17L2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L2Q6R6M4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L2Q6R6M4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP17L2Q6R6M4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L2Q6R6M4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L2Q6R6M4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms