Protein–RNA interactions for Protein: Q6QEF8

CORO6, Coronin-6, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CORO6Q6QEF8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CORO6Q6QEF8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CORO6Q6QEF8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CORO6Q6QEF8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237 ms