Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC27A1Q6PCB7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC27A1Q6PCB7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC27A1Q6PCB7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC27A1Q6PCB7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms