Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9A2

GALNT18, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18Q6P9A2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GALNT18Q6P9A2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GALNT18Q6P9A2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GALNT18Q6P9A2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms