Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC42EP5Q6NZY7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC42EP5Q6NZY7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CDC42EP5Q6NZY7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC42EP5Q6NZY7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms