Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ANKRD54Q6NXT1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ANKRD54Q6NXT1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ANKRD54Q6NXT1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ANKRD54Q6NXT1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms